В сентябре 2003 года мир столкнулся с чем-то ужасным. Кордицепс, который раньше поражал лишь насекомых, внезапно научился жить в людях. Гриб захватывал разум заражённых, превращая их в нечто чужеродное. В тот роковой день обычный рабочий Джоэл потерял самое дорогое, оказавшись в самом центре катастрофы.
Прошло два десятилетия. Теперь Джоэл выживает в Бостоне, где правит военное ведомство, подавляющее любые вспышки болезни. Вместе с Тэсс он ищет способ выбраться из города, чтобы найти пропавшего брата. Всё меняется, когда они сталкиваются с раненой женщиной — лидером сопротивления. Она предлагает сделку: машину и аккумулятор в обмен на то, что они проводят через зону карантина девочку-подростка по имени Элли. Её ждут соратники за пределами контролируемой территории.